אין דבר שמעורר את הטעם בחיים יותר מגילוי רגישותם של ילד או ילדה לעולם שסביבם, ואין דבר שמעורר תחושת מוות עזה יותר מאשר להתבונן בהם שעה שהתמימות נגזלת מהם. ישראל איננה מקום לתמימים, לרגישים או ליפי הנפש. מערכת שלמה של מוסכמות וחוקים הולכת ומפרקת את כל הקווים העדינים של הילדוּת לתוך אנושיות מחוספסת וקהה, שאחד היעדים העיקריים שלה הוא להסליל את הילדים אל הדבר שמגדיר את הזהות והאידיאל הישראלי יותר מכל: השירות הצבאי. "ימי תום" מספר את סיפורם של נערים ונערות שהתנגדו לשינוי הזה, שמטרתו להפוך אותם לחיילים. הסרט מבוסס על מלים, כתבים וקטעי וידיאו ביתיים של עשרות צעירים שמתו במהלך שירותם הצבאי.